由美國大學的領導的研究小組開發了一種從單個新冠病毒鼻咽拭子測試樣本就可以同時進行病毒和宿主測序的方法。團隊指，可以從樣本中產生出高保真度的全基因組、HLA測序、病毒基因組以及人類轉錄組。

同時分析逾百樣本

簡單來說，史丹福大學提出的測序方法能夠同時化驗病毒基因和化驗病人基因。儘管在過去曾經已有人提出使用鼻咽拭子樣本，以低通量的方式執行呼吸道病毒的全基因組測序，但是次報告提出的方法無論在時間上還是在被測對像數量上都大大加快了測序過程。有關研究已7月27日於醫學網站《MedRxiv》上刊登。

研究人員提出了一種低通量的方式把整個宿主基因組測序作為基因分型的替代方法，以便為大規模地提供遺傳信息，從而可以定期產生足夠質量的DNA用於宿主基因組和HLA測序。此外，他們亦提出了一種高通量的RNA測序工程，可對整個病毒基因組進行測序，並同時從數百個樣本中讀取人類轉錄組。

另一驚人發現是，鼻咽拭子測試可一次過收集大量人類的基因組數據，並且產生足夠的DNA來進行HLA類型的深度測序。這個是宿主進行免疫反應的重要部分。是次研究所提出的測序工程最重要的是它可以快速、大規模地應用在全球不同宿主和病毒的多組學數據存儲庫之中。

由於MedRxiv是一個用於發布尚未在正式期刊上發表的醫學相關電子出版物的網站，大多數文章都是未經同行評審的初步科學報告。因此，研究人員提醒不應視是次研究為結論性的信息。

Text by MEDICAL INSPIRE 醫·思維

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