【Omicron】人工智能計算抗體反應 美專家指現有疫苗仍可提供保護力

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Omicron大量棘狀蛋白突變近期引起關注,許多專家認為Omicron有能力避開人體免疫系統或降低疫苗的有效性。有美國專家現時用人工智能(Artificial Intelligence,AI)去評估Omicron與現有抗體的「反應」,並指出現在的疫苗仍可提供一些針對Omicron的保護力。

Omicron的出現令許多專家認為將有可能引起新一波前所未見的疫情,並一直密切注視以確定是否需要加強疫苗接種或重新設計過疫苗。在12月6日刊登在生物學資料庫bioRxiv,由北卡羅來納大學夏洛特分校(University of North Carolina at Charlotte)的人工智能架構師科爾比福特(Colby T. Ford )博士撰寫的研究報告指:「由於最初的病例是透過抽樣模式進行研究,加上患者是出現於某些低疫苗接種率的國家,剛好解釋了為甚麼新的病毒突變能避開人體免疫系統,無法被消滅。」

福特博士續指:「我們必須從AI計算機序列中推算出預測結構,然後模擬中和抗體與Omicron之間的反應(interaction ),評估人體免疫系統的能力,預測蛋白質的功能會否受到特定突變影響,並確定疫苗對它們的功效。」

透過HADDOCK預測Omicron與RDB結構的反應 圖片來源:bioRxiv

該報告最後指,確定蛋白質的實際結構是一個耗時的過程。鑑於迫切需要了解Omicron的影響力,因此要求採取比較快的實驗行動。雖然現在還需要更多實驗來驗證這些預測,但研究結果表明,現有的中和抗體仍與Omicron的突變蛋白結合,而Omicron的受體結合區域(Receptor-binding domain,RBD)對中和抗體的結合性(affinity)則有所降低,代表著疫苗或從先前感染中產生出來抗體仍能提供一些針對Omicron的保護力。

資料來源:bioRxivTwitter

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  • Text by Medical Inspire 醫·思維

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